ตามความถี่ในการใช้งาน มีทั้งเข็มเจาะแบบใช้แล้วทิ้ง และเข็มเจาะแบบใช้ซ้ำได้
จำแนกตามฟังก์ชั่นการใช้งาน: เข็มตรวจชิ้นเนื้อ, เข็มฉีด (เข็มแทรก) และเข็มระบายน้ำ
ตามโครงสร้างของหลอดเข็ม แบ่งออกเป็นเข็มเจาะ trocar เข็มเจาะเดี่ยว และเข็มเจาะแข็ง
ตามโครงสร้างปลายเข็ม แบ่งออกเป็นเข็มดูดเจาะ เข็มเจาะเข็ม เข็มเจาะส้อม และเข็มเจาะตัดแบบหมุน
จำแนกตามอุปกรณ์เสริม: เข็มเจาะแบบมีไกด์ (การวางตำแหน่ง), เข็มเจาะแบบไม่มีไกด์ (blind Puncture) และเข็มเจาะแบบมองเห็นได้